The latest one available in pandoc.org, I ran the script to uninstall it and then downloaded it again for macOS. I tested again with this file (prueba.md) that I created just to see if it woks with new files but I got the same result. [image: Captura de Pantalla 2021-05-27 a la(s) 12.54.14.png] However, when I convert the dxprevcovid19.md to .docx the table there renders fine. El jueves, 27 de mayo de 2021 a las 12:49:09 UTC-5, John MacFarlane escribió: > > That's very strange -- it looks like it is using extremely narrow > columns. But I can't reproduce this with latest pandoc. It > looks fine. What version are you using? > > Julio Vera writes: > > > [image: Captura de Pantalla 2021-05-27 a la(s) 12.27.20.png] > > > > Corrected it, but the tables are still not rendering. That's how I see > the > > tables inside the docx just for that file (pxdxcomp.md), when I convert > it > > to pdf they render fine. > > > > El jueves, 27 de mayo de 2021 a las 12:17:28 UTC-5, John MacFarlane > > escribió: > > > >> > >> Looks like you've got four ---- instead of three --- under the > >> YAML metadata block. > >> > >> > >> Julio Vera writes: > >> > >> > Hi! > >> > > >> > I attached 2 files. The one that I can't convert correctly is > >> pxdxcomp.md, > >> > the other one (dxprevcovid) I tried to convert it and had no issue. > The > >> > language of my work is in Spanish, I hope it isn't an issue here. I > >> tried > >> > copying everything and pasting it inside a new file but still have > the > >> same > >> > problem, also I uninstalled and installed pandoc. > >> > > >> > El jueves, 27 de mayo de 2021 a las 12:00:09 UTC-5, John MacFarlane > >> > escribió: > >> > > >> >> > >> >> Not much we can do to help without seeing the input markdown file... > >> >> > >> >> Julio Vera writes: > >> >> > >> >> > I usually just ran the following command: > >> >> > > >> >> > pandoc nameofile.md --citeproc -o nameofile.docx > >> >> > > >> >> > But today I was working with a particular .md file and after I > >> finished > >> >> > with it I tried to convert it, but the title, date and author > >> parameters > >> >> > that go inside the YAML block aren't converted, they display like > >> this: > >> >> > > >> >> > title: title of the document > >> >> > author: myname > >> >> > date: today > >> >> > > >> >> > But just in that format, not like it used to do. And also the > tables > >> >> aren't > >> >> > formatted, they and up in the docs like this: > >> >> > > >> >> > p t > >> >> > r 2 > >> >> > 1 2 > >> >> > 2 2 > >> >> > > >> >> > Just to say an example. I don't know hat happened. > >> >> > > >> >> > -- > >> >> > You received this message because you are subscribed to the Google > >> >> Groups "pandoc-discuss" group. > >> >> > To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, > >> send > >> >> an email to pandoc-discus...-/JYPxA39Uh5TLH3MbocFF+G/Ez6ZCGd0@public.gmane.org > >> >> > To view this discussion on the web visit > >> >> > >> > https://groups.google.com/d/msgid/pandoc-discuss/1abeeca5-7362-441d-907a-08df53958b28n%40googlegroups.com > >> >> . > >> >> > >> > > >> > -- > >> > You received this message because you are subscribed to the Google > >> Groups "pandoc-discuss" group. > >> > To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, > send > >> an email to pandoc-discus...-/JYPxA39Uh5TLH3MbocFF+G/Ez6ZCGd0@public.gmane.org > >> > To view this discussion on the web visit > >> > https://groups.google.com/d/msgid/pandoc-discuss/eaeda4d3-c7f4-430f-b569-e2fee781b831n%40googlegroups.com > >> . > >> > --- > >> > title: Diagnóstico situacional sobre la prevalencia de SARS-COV-2 en > >> perros, gatos y hurones de propietarios previamente diagnósticados con > el > >> virus. > >> > author: Julio Vera de León > >> > date: 25/Mayo/2021 > >> > bibliography: proyecto.bib > >> > csl: vca.csl > >> > --- > >> > > >> > # Título > >> > **H. CONSEJO TÉCNICO DE LA FACULTAD** > >> > **DE MEDICINA VETERINARIA Y ZOOTECNIA** > >> > > >> > **Presente** > >> > > >> > Él que suscribe, **Julio Vera de León**, alumnos de la Maestría en > >> Medicina Veterinaria y Zootecnia en el área de Salud Pública y Medicina > >> Preventiva, con número de cuenta 52101425-4. Pone a su consideración el > >> siguiente tema para diagnóstico de situación: > >> > > >> > **Diagnóstico situacional sobre la prevalencia de SARS-COV-2 en > perros, > >> gatos y hurones de propietarios previamente diagnósticados con el > virus.** > >> > > >> > Que será realizado en el **Departamento de Medicina Preventiva y > Salud > >> Pública de la Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia de la UNAM** > y > >> que pertenece al campo de profundización profesional: **Medicina > Preventiva > >> y Salud Pública**. Bajo la asesoría del comité tutor conformado por el > >> **Dr. MSP Juan Ramón Ayala Torres**, la **MCV. Patricia Mora Medina** y > el > >> **MCV. Jorge Francisco Monroy López** > >> > > >> > # Introducción > >> > > >> > El sustento de este diagnóstico de situación viene de que a la fecha > es > >> desconocido por el autor algún material bibliográfico o de consulta en > el > >> que se tengan datos referentes al número de animales que han sido > >> infectados por el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 > >> (SARS-COV-2). Esto a pesar de que la infección en los animales por > >> SARS-COV-2 cumple los criterios de la OIE como enfermedad emergente.[^1] > >> > > >> > Es relevante tener datos que nos permitan conocer la prevalencia del > >> agente en los animales de compañía con los que mantenemos una relación > más > >> cercana. > >> > > >> > [^1]: Enfermedad emergente por la OIE: La aparición de una > enfermedad, > >> infección o infestación nueva y que impacta en la sanidad animal o la > salud > >> humana. > >> > > >> > A la fecha existen al menos 4 distintas instituciones en América que > >> están realizando estudios de muestreo para conocer la cantidad de > animales > >> de compañia infectados por contacto con sus propietarios, las cuales > son: > >> > > >> > 1. [Ontario Veterinary College, University of Guelph]( > >> https://ovc.uoguelph.ca) > >> > 2. [Cummings School of Veterinary Medicine at Tufts University]( > >> https://sites.tufts.edu/covers/) > >> > 3. [Texas A&M University, College of Veterinary Medicine & Biomedical > >> Sciences](https://vetmed.tamu.edu/hamer-lab/covid-19-pets-research/) > >> > 4. [University of Washington Center for One Health Research]( > >> https://deohs.washington.edu/cohr/covid-19-and-pets-study-caps) > >> > > >> > La evidencia apunta a que la epidemia provocada por SARS-COV-2 se > >> mantiene principalmente por la transmisión de humanos hacia otros > humanos, > >> por lo que en este estudio el enfoque será conocer la cantidad de > animales > >> que han sido infectados por sus propietarios, factores que > contribuyeron a > >> la infección, y conocer los tipos de casa en los que hubo más riesgo de > >> infección a las mascotas. Aunado a lo anterior, la OIE no descarta a > los > >> animales salvajes y domésticos como reservorios futuros de la > enfermedad y > >> que puedan representar un problema para la salud pública, por lo que > >> sugiere el monitoreo cercano de las especies con las que más > convivimos. De > >> igual forma, la introducción constante del virus a nuevas poblaciones > >> animales puede llevar a mutaciones que puedan afectar la sanidad animal > o > >> salud humana. > >> > > >> > A la fecha la OIE cuenta con información referente a las especies de > >> interés en este diagnóstico en cuánto a la susceptibilidad que tienen > al > >> virus, se pone en la siguiente tabla:[@OIE2021] > >> > > >> > | Especie | Tipo de infección | Susceptibilidad a la infección | > Signos > >> clínicos | Transmisión | > >> > | ------------------ | ---------------------- | > >> ------------------------------ | -------------------------- | > >> ----------------- | > >> > | Hurones | Natural y experimental | Alta | Sí (sólo en algunos > casos) | > >> Sí, entre hurones | > >> > | Gatos (domésticos) | Natural y experimental | Alta | Sí (sólo en > >> algunos casos) | Sí, entre gatos | > >> > | Perros | Natural y experimental | Baja | Sí (sólo en algunos casos) > | > >> No | > >> > Table: SARS-COV-2 en Hurones, perros y gatos (adaptado de la OIE) > >> > > >> > A pesar de que la información actual ha mencionado que la epidemia se > >> mantiene por medio de la transmisión humano-humano, no se puede > descartar > >> como un componente de esta cadena de transmisión a los animales de > >> compañia, aunque su papel de momento sea mucho menos relevante. De ahí > que > >> una de las indicaciones que contempla la CDC sea la de mantener a los > >> animales separados junto con su propietario y reconoce el riesgo de > >> transmisión desde la mascota es bajo. [@CDC2021] > >> > > >> > # Justificación > >> > > >> > La detección del material genético del virus de SARS-COV-2 en perros > y > >> gatos se ha demostrado en animales con y sin signología, así como > también > >> en el suero de mascotas que se han muestreado en zonas afectadas, por > lo > >> que la infección en estas especies está comprobada, y más importante se > ha > >> comprobado que llegan a diseminar material viral con una cantidad > necesaria > >> que ha demostrado ser capaz de infectar a otros animales con los que > >> conviven. @Patterson2020 > >> > > >> > En contraste con lo mencionado anteriormente, las especies de > producción > >> como cerdos (*Sus scropha*) y aves (gallinas, patos y pavos) han > demostrado > >> de nula a extremadamente baja susceptiblidad de infección de manera > >> experimental, además de que no se ha comprobado sean capaces de > transmitir > >> la enfermedad. @Shi2020 De manera similar los bovinos (*Bos taurus*) > que se > >> han inoculado experimentalmente con el agente viral han demostrado una > >> susceptibilidad baja al agente y nula capacidad de transmisión del > mismo. > >> @Ulrich2020 > >> > > >> > Debido a que las especies usadas comúnmente en la ganadería no han > >> demostrado ser suceptibles al virus, se decide enfocar el diagnístico > de > >> situación en perros, gatos y hurones. De estos tres es de particular > >> relevancia mencionar a los hurones domésticos (*Mustela outorius > furo*), ya > >> que pertenecen a la familia *Mustelidae* y guardan una relación > taxonómica > >> con los mustélidos usados en granjas como lo es el visón americano > >> (*Neovison vison*) y visón europeo (*Mustela lutreola*), estos últimos > >> responsables del brote de SARS-COV-2 que llevó a la eutanasia de 17 > >> millones de visones.[^2] > >> > > >> > Aunque los hurones domésticos frecuentemente se encuentran separados > de > >> otros y no son capaces de mantener la propagación del virus de manera > >> estable @Gortazar2021, el gobierno del Reino Unido ha emitido una guía > >> especial para los dueños de estos animales debido al riesgo que pueden > >> representar [^3]. > >> > > >> > [^2]: [¿Por qué Dinamarca sacrificó 17 millones de visones?]( > >> > https://www.nbcnews.com/news/animal-news/here-s-why-denmark-culled-17-million-minks-now-plans-n1249610 > >> ) > >> > > >> > [^3]: [Medidas preventivas en lo que respecta al SARS-COV-2 y los > >> hurones en el Reino Unido]( > >> http://apha.defra.gov.uk/documents/guidance-sars-cov-2-ferrets.pdf) > >> > > >> > Es así que en consideración al Código Sanitario para los Animales > >> Terrestres que contempla al SARS-COV-2 como una enfermedad emergente y > la > >> falta de datos al respecto de la enfermedad en los animales domésticos, > es > >> necesario realizar un diagnóstico de situación en nuestra población. > >> > > >> > # Referencias > >> > --- > >> > title: Ejercicio de pruebas diagnósticas complementarias > >> > author: Julio Vera de León > >> > date: 26/Mayo/2021 > >> > ---- > >> > > >> > # Primer prueba > >> > > >> > La primer prueba tamiz que se usa para brucelosis es la de anillo en > >> leche. > >> > > >> > Se hizo un diagnóstico con la prueba tamiz de anillo en leche para > >> detectar a los hatos positivos a la enfermedad, estos hatos cuentan con > >> 10.000 animales, los cuales fueron evaluados individualmente para > encontrar > >> los positivos; a través de la prueba tamiz de rosa de bengala la cual > tiene > >> una sensibilidad del 95.2% y una especificidad del 98.5%. > >> > > >> > | Prueba | Positivos | Negativos | Total | > >> > | --------- | --------- | --------- | ----- | > >> > | Positivos | 286 | 145 | 431 | > >> > | Negativos | 14 | 9555 | 9569 | > >> > | Total | 300 | 9700 | 10000 | > >> > > >> > 1. Sanos: 9555 > >> > 2. Enfermos postprueba: 286 > >> > 3. Falsos positivos: 145 > >> > 4. Falsos negativos: 14 > >> > 5. Valor predictivo positivo: 66% > >> > 6. Valor predictivo negativo: 99% > >> > 7. Positivos a la prueba: 431 animales positivos, incluyendo falsos > >> positivos. > >> > > >> > Son muchos animales (431) que se van a eliminar incluyendo los 145 > >> falsos positivos, sacrificando 145 animales que no deberían > sacrificarse, > >> por lo que es necesario después de la prueba tamiz realizar una prueba > >> mucho más especifica, por lo que se sugierte una prueba con mas > >> especificidad para bajar la cantidad de falsos positivos. > >> > > >> > # Segunda prueba > >> > > >> > La siguiente prueba se hace en paralelo, la norma dice que la segunda > >> prueba es la *prueba de ribanol*. Esta tiene una sensibilidad del 96.4% > y > >> especificidad de 98.7% > >> > > >> > Cuadro de 2x2: > >> > > >> > | Prueba | Positivos | Negativos | Total | > >> > | --------- | --------- | --------- | ----- | > >> > | Positivos | 276 | 2 | 278 | > >> > | Negativos | 10 | 143 | 153 | > >> > | Total | 286 | 145 | 431 | > >> > > >> > 1. En que animales se aplicaría? Sobre el total de positivos, que > sería > >> 431 > >> > 2. Verdaderos positivos: 276 > >> > 3. Verdaderamente sanos: 143 > >> > 4. Falsos positivos: 2 > >> > 5. Falsos negativos: 10 > >> > 6. Valor predicitvo positivo: 99% > >> > 7. Valor predictivo negativo: 93% > >> > > >> > # Tercer prueba > >> > > >> > Al realizar un tercer diagnóstico con la prueba de fijación del > >> complemento (confirmatoria) con una sensibilidad del 97.5% y > especificidad > >> del 99% > >> > > >> > Cuadro 2 x2: > >> > > >> > | Prueba | Positivos | Negativos | Total | > >> > | --------- | --------- | --------- | ----- | > >> > | Positivos | 269 | 0 | 269 | > >> > | Negativos | 7 | 2 | 9 | > >> > | Total | 276 | 2 | 278 | > >> > > >> > 1. Animales falsos positivos que seran eliminados: 0 > >> > 2. Animales falsos negativos que quedarán en el hato: 7 > >> > 3. Valor predictivo positivo: 100%. Quiere decir que de los animales > a > >> los que se les hace la prueba y están enfermos, el 100% saldrán con un > >> respultado positivo. > >> > 4. Valor predictivo negativo: 22%. Quiere decir de los animales a los > >> que se les hace la prueba y están sanos, solamente el 22% tiene > >> probabilidad de estar realmente sano si salió negativo. > >> > > >> > # Después de las pruebas > >> > > >> > Al realizar un diagnóstico a los 6 meses de iniciado el programa: > >> > > >> > 1. ¿Cuál es la prevalencia real final de la enfermedad en la cuenca > >> lechera? 2.8% (278/10000) > >> > 2. La prevalencia real en el 3er cuadro: 99.3% > >> > 3. ¿Cuál es la prevalencia aparente en el 3er cuadro? 2.7% () > >> > 4. Repercusiones de dejar a los animales falsos negativos en el hato > es > >> que se quedan 7 animales con brucella, que pueden seguir contagiando y > >> prevalece la enfermedad. > >> > > >> > El costo de la prueba da anillo en leche es absorbido por el gobierno > >> como una ayuda a los productoras y un incentivo para erradicar esta > >> zoonosis de tos animales. Sin embargo, el costo de las demás pruebas es > >> erogado por los productores: > >> > > >> > 1. Costo de diagnosticar a los 10,000 animales con rosa de bengala > >> (anillo en leche), si esta prueba cuesta $0.15 por 100 animales: 15 > pesos > >> > 2. Costo de diagnosticar $1 por 100: serían $4.3 > >> > 3. Costo de diagnosticar fijación por complemento $500 por 100 > animales: > >> $1390 > >> > 4. Costo de eliminar a los animales positivos y falsos positivos > >> (separadamente), si una vaquilla de reemplazo cuesta $1,000 dolares. > Costo > >> de positivos: $278,000 dolares. > >> > 5. Costo total de las 3 pruebas y de los animales a sacrificar: De > las 3 > >> pruebas son $1409.3 pesos. > >> > > > > -- > > You received this message because you are subscribed to the Google > Groups "pandoc-discuss" group. > > To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send > an email to pandoc-discus...-/JYPxA39Uh5TLH3MbocFF+G/Ez6ZCGd0@public.gmane.org > > To view this discussion on the web visit > https://groups.google.com/d/msgid/pandoc-discuss/edd6a94c-a735-494d-88c5-bacabb6842b0n%40googlegroups.com > . > -- You received this message because you are subscribed to the Google Groups "pandoc-discuss" group. To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to pandoc-discuss+unsubscribe-/JYPxA39Uh5TLH3MbocFF+G/Ez6ZCGd0@public.gmane.org To view this discussion on the web visit https://groups.google.com/d/msgid/pandoc-discuss/932560f4-7866-4fd4-90e7-4797e23fab20n%40googlegroups.com.